پاورپوینت فصل هفتم 7 (ارتباط دستگاه نسخه برداري با کروماتین )کتاب بیوشیمی کروماتین نویسنده دکتر بهزاد لامع رادو دکتر سعیدیانو گل بداق ,

پاورپوینت فصل هفتم 7 (ارتباط دستگاه نسخه برداري با کروماتین  )کتاب بیوشیمی کروماتین نویسنده دکتر بهزاد لامع رادو دکتر سعیدیانو گل بداق

در قالب ppt و در 24 اسلاید و قابل ویرایش

قسمتی از متن فایل::

مقدمه

در شرایط خارجی سلولی می‌توان نوکلئوزوم ها را به کمک قطعات معینی از DNA و هیستون هاي خالص شده، تهیه نمود. ادغام برخی از توالی هاي DNA به عنوان پروموتر یا توالی هاي خاصی از DNA که پروتئین ها به آن متصلند، براي مطالعه ي نقش نوکلئوزوم ها (یا فاکتورهاي متصل به آنها) در عمل نسخه برداري بسیار با ارزش است. اگر یک توالی خاصی از DNA همراه با نوکلئوزوم هاي آن را داشته باشیم، اکتامر هیستون در جایگاه خاصی از DNA قرار می‌گیرد. بنابراین یک سیستم ساده در شرایط خارج سلولی خواهیم داشت. با توجه به این که ذرات نوکلئوروم در شرایط داخل سلولی با درجه نظم بالا هستند، بنابراین عملکرد آن در شرایط خارج سلولی تحت عوامل فیزیکی با عملکرد آن در شرایط داخل سلولی به طور جزیی متفاوت خواهد بود. در فصل بعد شرایط پیچیده آزمایشگاهی جهت مدل سازي عوامل زیستی شرح داده خواهد شد.

بررسی اتصال فاکتورهاي نسخه برداري در شرایط خارج سلولی

مطالعاتی در خصوص اتصال پروتئین هاي پیوند شده به DNA با نوکلئوزوم هاي DNA در شرایط خارج سلولی انجام شده است. در این روش از شیب غلظت نمکی براي اتصال هیستون ها و قطعاتی از DNA که واجد یک یا چند ناحیه اتصال براي پروتئین ها می‌باشند، استفاده شده است. بدین ترتیب تمام پروتئین ها جهت اتصال با خودشان مخلوط شدند و نوکلئوزوم هاي تخلیص شده به همراه فاکتورهاي مورد نیاز تهیه گردیدند. سپس اتصال آنها در ژل الکتروفورز مورد مطالعه قرار گرفت. در مطالعه بر روي ژل الکتروفورز مشاهده شد که نوکلئوزوم هاي پیوند شده با پروتئین در طول ژل حرکتی آهسته تر از نوکلئوزوم هاي آزاد (پیوند نشده) دارند. در واقع این پروتئین پیوند شده همان پروتئین مورد نظر است که آن را از روي ژل برداشته و پس از صاف کردن توسط آنتی بادي ها نشاندار می‌شود. البته می‌توان قبل از الکتروفورز، آنتی بادي ها را به نمونه ها اضافه کرد و حرکت آهسته تر آن را بررسی نمود. خلاصه اي از این نتایج رادر شکل 7 -1 مشاهده می‌کنید.