پاورپوینت فصل پنج 5 (سازماندهی ساختار کروماتین با درجه نظم بالاتر )کتاب بیوشیمی کروماتین نویسنده دکتر بهزاد لامع رادو دکتر سعیدیانو گل بداق ,

پاورپوینت فصل پنج 5 (سازماندهی ساختار کروماتین با درجه نظم بالاتر )کتاب بیوشیمی کروماتین نویسنده دکتر بهزاد لامع رادو دکتر سعیدیانو گل بداق

در قالب ppt , و در 34 اسلاید و قابل ویرایش

قسمتی از متن فایل::

مقدمه

در فصل قبل به اینجا رسیدیم که رشته هاي طویل DNA با عملکردهاي مختلف چگونه داخل هسته سلول قرار می‌گیرند. بعد از این که واحد اصلی ساختار کروماتین مشخص شد باید به نقش احتمالی آن یعنی تنظیم بیان ژن پرداخت. به هر حال، نوکلئوزوم اولین مرحله بسته بندي DNA در داخل هسته سلول است. براي این که بدانیم بسته بندي DNA تا کجا پیش می‌رود نیاز به بررسی بیشتر ي است. در هسته سلول طول DNA انسان حدود 2 متر است. از طرف دیگر، طول کلی مجموعه تمام 46 کروموروم انسان در مرحله متافاز حدود µm 200 یا m -4 10× ٢ است (در حقیقت این طول مربوط به 46 کروموزوم انسان روي شیشه اسلاید است). بنابراین، مجموع کاهش طول ژنوم درمتافاز حدود 10000 مرتبه است. در مرحله آنافاز فشردگی کروموزوم کمتر است و به 250 مرتبه می‌رسد. وقتی در نوکلئوزوم، DNA به صورت سوپر کویل در می‌آید، طول آن تقریبأ 7 مرتبه کاهش می‌یابد. بنابراین باید تاخوردگی بیشتري در سطوح بالاتر براي از بین بردن شکاف بین رشته هاي کروماتین و کروموزوم هاي متافازي وجود داشته باشد. با استفاده از میکروسکپ الکترونی و کریستالوگرافی اشعه – x می‌توان ساختار نوکلئوزوم را تعیین کرد. هسته هاي لیز شدهزیر میکروسکپ الکترونی رشته هایی با قطر nm 30 را نشان داد(شکل 5 -1).

رشته هاي 30 نانومتري

مدل هاي ساختاري ارایه شده امکان ساختارهاي کروماتین با سطح تاخوردگی بالاتر را نشان می‌دهند. همیشه بهترین روش براي شروع، بررسی ساختار ساده و کار کردن روي آن است و در این مرحله قدم اول بررسی ساختار نوکلئوزوم دو تایی است. این مرحله از آزمایش ها کاملاً آموزنده است، چون نوکلئوزوم دو تایی بعضی از محدودیت هاي جدي را بر خلاف رشته هاي 30 نانومتري، ندارد. مسیرعبور رشته DNA در نوکلئوزوم دو تایی (منظور نحوه عبور رشته DNA از یک نوکلئوزوم به نوکلئوزوم دیگراست).

حلقه هاي DNA

بعضی از آزمایش هاي انجام شده در دهه 1960 اطلاعات مهمی از نحوه سازمان یافتگی خود DNA درون هسته سلول هاي یوکاریوتی ارایهدادو نکات مهمی درمورد نحوه سازمان یافتگی کروماتین ماوراي رشته 30 نانومتري فراهم کرد. اگرهسته اي را از محیط کشت حاوي سلول هاي خاصی (مثلاً سلول هاي HeLa ( تهیه کنیم و با استفاده از سدیم کلرید M 2 آن را استخراجنماییم، تمام هیستون ها به انضمام سایر پروتئین ها حذف می‌شوند، در نتیجه ساختار شبه هسته اي قابل تشخیص مانند نوکلئوئید (nucloid) باقی می‌ماند. اگر احتیاط لازم براي مهار نوکلئازها را انجام شود، DNA نیز محافظت می‌شود و می‌تواند توسط رنگ هاي فلورسنت دیده شوند ومانند هاله اي ازآنچه که از هسته باقی مانده، احاطه گردد(شکل 5 -8.)